Каждая биологическая система очистки требует определённой массы активных микроорганизмов для заселения установки в начале работы или для восстановления биологической популяции после сбоя системы.
Некоторым технологиям, таким как анаэробные процессы с использованием гранулированного ила, для правильной работы необходимы специализированные формы биомассы. Этот материал часто трудно найти из-за высокого спроса, что может задержать запуск или перезапуск процесса.
Если биомасса недоступна локально, её транспортировка издалека может быть дорогой. В некоторых случаях требуется большое количество биомассы, и достаточные объемы просто отсутствуют в определённых регионах.